現在，EDBでは毎日午前3:00頃に，原典情報(XML表現の情報)のバックアップをとっている．
バックアップディレクトリは，
- valkyrie:/home3/backup/
- walkyrie:/home3/backup/
である．
このディレクトリにあるファイル群は，
- YYYYMMDD.database-table.dmp.gz …テーブル情報のバックアップ
- YYYYMMDD.database-tuple.dmp.gz …タプル情報のバックアップ
- YYYYMMDD.authentication.dmp.gz …認証情報のバックアップ
のように名前が付けられており，
YYYYMMDDの部分は西暦年月日である．
これらの3つのファイルでEDBに登録されている情報を全て再構築可能である．
なお，これらのバックアップファイルは定期的にCD-R等に転写し，不必要なバックアップは消去する必要がある．（ハードディスクが溢れないようにするため）
バックアップコマンドは edb_dump で，利用方法は
- { valkyrie | walkyrie }% edb_dump dbname template
である．(通常，
templateに
YYYYMMDDを指定する)
edb_dump にて作成されたファイルを gzip で圧縮したものが上記のファイルである．
このコマンドで作成されたバックアップファイルは edb_restore コマンドを用いてデータベースに戻すことができる．